A continuación se muestra el Organigrama de la Institución y la Estructura Orgánica donde se establece la organización Interna de la Superintendencia de Salud.
Para el cumplimiento a las funciones, y en el marco de la Misión de la Superintendencia de Salud, y de los criterios e instrucciones que imparte el Superintendente, la Institución se organiza orgánica y funcionalmente de acuerdo a la siguiente estructura:
2° INTENDENCIA DE FONDOS Y SEGUROS PREVISIONALES DE SALUD
3° INTENDENCIA DE PRESTADORES DE SALUD
5° DEPARTAMENTO DE ADMINISTRACIÓN Y FINANZAS
6° DEPARTAMENTO DE ESTUDIOS Y DESARROLLO
7° DEPARTAMENTO DE POLÍTICAS PÚBLICAS
8° GESTIÓN CORPORATIVA Y PARTICIPACIÓN CIUDADANA
10° UNIDAD DE AUDITORÍA INTERNA
11° UNIDAD DE PLANIFICACIÓN, INNOVACIÓN Y CONTROL DE GESTIÓN
12° UNIDAD DE DATOS Y ESTADÍSTICAS
Resolución Exenta N°741 del 01/08/2023 que establece Estructura y Organización Interna en la Superintendencia de Salud y modifica la Resolución Exenta N°1238 y sus modificaciones.